PUMA
Istituto di Scienze Marine     
Ruggeri P., Splendiani A., Bonanomi S., Arneri E., Cingolani N., Santojanni A., Belardinelli A., Giovannotti M., Caputo V. Temporal genetic variation as revealed by a microsatellite analysis of European sardine (Sardina pilchardus) archived samples. In: Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, vol. 69 pp. 1698 - 1709. NRC Research Press, 2012.
 
 
Abstract
(English)
The Adriatic stock of European sardine (Sardina pilchardus) has experienced large interannual demographic fluctuations over the last 30 years, with a severe decline beginning in 1991 and continuing until 1997. In the present study, six microsatellite loci were used on a time series collection of otoliths and scales from sampling locations of northern (Chioggia) and southern (Vieste) Adriatic Sea, with the aim to investigate the genetic effects of these stock biomass fluctuations. The northern samples showed significant reduction in observed heterozygosity (HO) and mean number of alleles (Na) that explain the genetic diversity variation, while the same parameters turned out to be more stable in the southern samples. In addition, we detected the presence of a genetic bottleneck and low effective population size (Ne) values in several northern samples. Even if the northern and southern Adriatic sardine samples belong to the same genetic stock, the more pronounced decrease in genetic variability recorded in the northern sample led us to speculate that a more intensive fishing pressure and a more pronounced oceanographic isolation of this area could have accentuated the effects of the genetic bottleneck.
Abstract
(Italiano)
Le stock adriatique de sardines (Sardina pilchardus) a connu de grandes fluctuations démographiques interannuelles au cours des 30 dernières années, dont une importante diminution entre 1991 et 1997. Dans la présente étude, six sites microsatellites ont été utilisés sur une collection d'otolites et d'écailles formant une série chronologique et provenant de sites d'échantillonnage du nord (Chioggia) et du sud de la mer Adriatique, dans le but d'évaluer les effets génétiques de ces fluctuations de la biomasse du stock. Les échantillons provenant du nord présentaient des diminutions significatives de l'hétérozygotie observée (HO) et du nombre moyen d'allèles (Na) qui expliquent les variations de la diversité génétique, alors que ces paramètres se sont avérés plus stables pour les échantillons du sud. Nous avons en outre détecté la présence d'un goulot d'étranglement génétique et de faibles valeurs de la taille effective de la population (Ne) dans plusieurs échantillons nordiques. Même si les échantillons de sardines de l'Adriatique nord et sud appartiennent au même stock génétique, la diminution plus prononcée de la variabilité génétique observée dans l'échantillon du nord nous porte à postuler qu'une pression de pêche plus intense et l'isolement océanographique plus prononcé de cette région pourraient avoir accentué les effets du goulot d'étranglement génétique.
DOI: 10.1139/F2012-092
Subject Sardina pilchardus


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